近日,深圳大学-香港科技大学海洋环境科学联合培养博士生邹大雨同学在微生物权威期刊“Environmental Microbiology”(影响因子:5.434;doi号:10.1111/1462-2920.14613)上发表了题为“Genomic adaptation to eutrophication of ammonia-oxidizing Archaea in the Pearl River estuary”的论文。2017级深圳大学-香港科技大学联合培养项目博士研究生邹大雨同学为该论文第一作者,深圳大学高等研究院导师李猛教授及香港科技大学海洋科学系导师刘红斌教授为共同通讯作者。
氨氧化古菌(Ammonia-oxidizing archaea,AOA)普遍存在于自然界中,由于其可以进行氨氧化反应,是全球氮元素循环中不可或缺的重要成员。通过高通量测序,利用宏基因组的方法,从珠江口近岸的底层水体中,该研究论文重构了多个高质量的氨氧化古菌的基因组。结合氨氧化速率的测定以及对氨单氧酶α亚基(alpha subunit of ammonia monooxygenase;amoA)基因型分析,该研究还发现这类古菌是珠江口近岸底层水体中最主要的氨氧化反应的贡献者。研究对这些重构的基因组进行了深入分析,揭示了这些古菌能够适应珠江口水体中富营养化环境的机制,为河口氨氧化古菌的研究提供了新思路。
此研究得到了来自国家自然科学基金、香港科学基金委员会、国家重点实验室项目子课题的资助,该论文是深圳大学-香港科技大学海洋环境科学联合培养项目的首篇研究论文,标记着该联合培养项目已经进入新的阶段。
珠江口氨氧化古菌的代谢机制简图