2026年4月20日,李猛教授团队在《Scientific Data》在线发表论文 A seven-year metagenomic genome catalogue of mangrove and mudflat sediments from the Futian Reserve, China。李猛教授为通讯作者,戚雁玲博士后为第一作者,深圳大学为唯一完成单位。
研究团队围绕深圳福田红树林国家级自然保护区,建立了跨越七年的沉积物宏基因组资源库。研究共采集2017至2023年间65份沉积物样品,覆盖红树林与邻近光滩两类配对生境及多个沉积深度层位。测序共获得约5.3 Tb数据,并从中重构出6,922个宏基因组组装基因组,进一步去冗余后获得3,404个代表性基因组,其中包括336个古菌基因组和3,068个细菌基因组。系统发育分析显示,该资源库覆盖13个古菌门和69个细菌门,展现出福田红树林与光滩沉积物中丰富而广泛的微生物物种多样性(图1)。其中,大量谱系仍缺乏正式命名,提示该生态系统中仍蕴藏着丰富的潜在新类群和未被充分认识的微生物遗传资源。
该研究的核心价值在于构建了一个标准化、时间分辨的红树林湿地沉积物微生物基因组目录,并同步公开原始测序数据、组装基因组及详细样品元数据。这一资源将为沿海湿地微生物生态学、比较基因组学、环境功能挖掘及生态修复评估等研究提供重要支撑,也为进一步解析红树林“蓝碳”生态功能及其微生物驱动机制奠定了长期数据基础。
研究获得广东省基础与应用基础研究重大项目、国家自然科学基金、深圳大学2035卓越研究计划、深圳大学专项资助计划、深圳市自然科学基金基础研究面上项目、深圳大学合成生物学研究中心支持和深圳大学智算中心的支持。
原文链接:https://www.nature.com/articles/s41597-026-07291-3

图1. 深圳福田红树林与邻近光滩沉积物七年宏基因组数据集概览